サバイバルモードでは、エンドポータルフレームをクラフトすることも、アイテムとして回収することも不可能です。プレイヤーは地下深くのどこかに自動生成される「要塞(ストロングホールド)」を自力で見つけ出さなければなりません。
要塞を探す唯一の手がかりが「エンダーアイ」です。地上でエンダーアイを空中に投げると、アイは要塞がある方角へ向かってゆっくりと飛んでいきます。何度か投げ直しながらその軌跡を追い、アイが地面に向かって吸い込まれるように落ちた場所の直下を掘り進めましょう。そこには、暗く危険な要塞の遺跡と、すでに設置されているエンドポータルがあなたを待っています。