CDデビューや日本武道館公演など、エンタメの頂点を極めた吉本印天然素材でしたが、その活動期間は決して長くはありませんでした。天然素材の解散理由には、表舞台の華やかさとは裏腹に、メンバーが抱えていた深刻な「芸人としてのアイデンティティの危機」が存在します。
最大の要因は、「お笑いをやるために吉本に入ったのに、ネタ作りよりもダンスの練習ばかりを求められる」という根本的なジレンマでした。連日何時間も夏まゆみ氏から怒鳴られながらダンスの特訓を受け、劇場に出ればネタの面白さではなくルックスや振る舞いに対して黄色い歓声が飛ぶ状況に、芸人としてのプライドが激しく揺さぶられていたのです。
決定打となったのは、1994年におけるナインティナインの脱退でした。フジテレビ系の伝説的バラエティ『とぶくすり』への抜擢など、単独での東京本格進出が決まったナイナイは、「天素のアイドル的な見せ方から脱却し、本格的なお笑いで勝負したい」という強い意思のもとでグループを離脱。続いてリーダー格であった雨上がり決死隊も脱退しました。
主力を失ったグループは、残されたFUJIWARAやバッファロー吾郎らを中心に活動を継続したものの、ブームの熱狂は次第に落ち着き、1999年に事実上の活動休止・解散を迎えました。