どれほど優れたスーパーフードであっても、無制限に食べてよいわけではありません。めかぶを摂取する際に唯一注意しなければならないのが、海藻類全般に多く含まれるミネラル「ヨウ素（ヨード）」の過剰摂取です。
ヨウ素は甲状腺ホルモンを合成するために不可欠な栄養素ですが、長期間にわたって過剰に摂取し続けると、かえって甲状腺機能の低下や甲状腺腫を引き起こすリスクが存在します。日本人の食事摂取基準において、成人のヨウ素耐容上限量は1日あたり3,000μg（3.0mg）と設定されています。
めかぶ1パック（約40g）に含まれるヨウ素の量は約100〜150μg程度であり、昆布などに比べると含有量は控えめです。したがって、通常の食生活であれば過度に恐れる必要はありませんが、適量を守る意識は不可欠です。健康維持を目的とするならば、「1日1〜2パック」を目安に継続することが、最も安全で効果的な取り入れ方となります。
