本田圭佑さんと美沙子さんの間には、現在3人の子供（長男・長女・次男）が誕生しています。2012年秋に長男、2014年に長女、そして2017年に次男が誕生したことが公表されており、子育てに関しても独自のグローバルな視点が貫かれています。
本田さんの公式インスタグラムにも、稀に子どもたちと海辺を歩く後ろ姿や、サッカーボールを追いかけるシルエットなどの家族写真が投稿されることがあります。子どもの顔や個人情報は完全に保護されつつも、家族と過ごす温かい時間が伝わってくる一枚には、世界中のファンから数十万件の「いいね」が寄せられます。
オランダ、ロシア、イタリア、メキシコ、オーストラリア、カンボジアなど、世界各国を渡り歩いてきた本田家。子どもたちも幼少期から多言語・多文化に触れる環境で育っており、固定観念にとらわれないインターナショナルな教育方針が実践されています。
