てんさい糖には、善玉菌のビフィズス菌を増やすとされるラフィノースなどのオリゴ糖が含まれている。この点が腸活や菌活を意識する層に支持される理由だ。予防医学・栄養学の観点からも、腸内環境の多様性を整える効果自体は肯定的に評価されている。
しかし、消化器系が過敏な人やお腹を下しやすい体質の人にとっては、このオリゴ糖が裏目に出るケースがある。一度に大量のオリゴ糖を摂取すると、腸内で急激に発酵が進み、腹部膨満感やガス、あるいは軟便を引き起こす可能性があるのだ。さらに、FODMAP（フォドマップ）制限食を必要とする過敏性腸症候群（IBS）の患者にとっては、てんさい糖に含まれる糖質が腹痛などの症状を悪化させるリスクも指摘されている。
