この「木原誠二夫妻疑惑報道」において最大の論点となったのは、警察当局による捜査の手順と、政権中枢の権力による圧力の有無だった。過去の不審死事案がなぜ一度は収束し、なぜ特定のタイミングで再浮上したのか。元取調官による実名での証言が飛び出すなど、前代未聞の展開を見せた。
警視庁側は「事件性はない」との見解を一貫して主張したが、捜査機関の公式発表と元捜査員個人の証言との間に生じた食い違いは、国民に大きな不信感を植え付けた。権力の影が捜査に影響を与えたのではないかという懸念は、今も完全に払拭されたとは言い難い。