予約時に多くの方が迷うのが客室選びです。快適な滞在を実現するためには、建物の構造と瀬の本高原ホテルのおすすめの部屋を押さえておく必要があります。
館内は主に「本館」と「西館」に分かれており、最も人気が高いのは近年モダンにリノベーションされた本館の「絶景側和洋室」や「プレミアムツイン」です。大きなピクチャーウィンドウから阿蘇の山並みを絵画のように一望でき、シモンズ社製ベッドを備えた快適な睡眠環境が整っています。静かに絶景を堪能したいカップルやご夫婦には、間違いなくこのリニューアル客室が推奨されます。
一方で、リーズナブルに泊まれる西館の和室やスタンダード客室は、どこか懐かしい昭和レトロな雰囲気が残ります。清潔感は保たれているものの、水回りの構造やコンセントの配置などに築年数を感じる部分もあるため、設備の真新しさを重視する方は予約時に客室タイプをしっかりと指定するのが賢明です。
客室のアメニティや館内設備については、滞在に必要な基本アイテム（歯ブラシ、タオル類、浴衣、ドライヤー、各種バスアメニティ）が過不足なく揃っています。ロビー周辺では無料Wi-Fiが快適に利用でき、湯上がり処には冷水のサービスも用意されています。高原の澄んだ空気を感じながら読書ができるラウンジスペースなど、思い思いにくつろげる空間設計がなされています。
