長年、多くのダイバーが訪れながらも、最深部である海底124メートルの状況は長らく厚いベールに包まれていました。しかし、近年実施された大規模な潜水調査プロジェクトによって、グレートブルーホールの底の調査結果が世界に向けて公開され、大きな衝撃を与えました。
海洋探検家ファビアン・クストー（ジャック・クストーの孫）や英ヴァージン・グループ創業者のリチャード・ブランソン氏らが率いる調査チームは、最先端の有人潜水艇「アクアティカ」を用いて最深部まで潜航し、ソナーによる3Dマッピング探査と高精細カメラによる記録を行いました。そこで確認されたのは、上層の美しい海とは完全に切り離された「異様な世界」でした。
水深約90メートル付近に到達すると、突如として視界が白く濁り、光が完全に遮断されます。これは高濃度の硫化水素（H2S）が滞留する有毒な層です。有機物が分解される過程で発生した硫化水素が、海水の循環が途絶えた深部に長年蓄積された結果、厚いバリアのような層を形成していました。
この硫化水素層の下は、太陽光が一切届かない漆黒の闇であると同時に、酸素が完全にゼロの「無酸素地帯」です。魚類をはじめとする好気性生物は一切生息できず、穴に誤って転落した海洋生物（貝類、カニ、小魚など）が窒息死し、腐敗もせずにそのまま沈殿していました。さらに調査艇のライトが照らし出したのは、数十年前に投げ捨てられたとみられるプラスチックボトルや使い捨て容器といった人類のゴミの残骸でした。自然の神秘の最深部に刻まれた生々しい環境負荷の痕跡は、国際的な環境保護議論に一石を投じる結果となりました。
