現在の新宿駅西口店を語る上で欠かせないのが、6階を中心に展開されるブックオフ 新宿 アニメ館とブックオフ 新宿 トレカ 取扱フロアの熱気です。
ブックオフ 新宿 フィギュア 在庫は、ジャンプ系（『ONE PIECE』『ドラゴンボール』『鬼滅の刃』『呪術廻戦』など）の人気プライズフィギュアから、美少女系スケールフィギュア、さらには1980〜90年代のレトロ玩具まで圧巻のラインナップを誇ります。昨今の円安と訪日外国人ブームが重なり、免税カウンターを利用してまとめ買いしていくインバウンド客の姿が日常的な風景となっています。
また、トレーディングカードコーナーでは、『ポケモンカードゲーム』『遊戯王OCG』『ONE PIECEカードゲーム』『マジック：ザ・ギャザリング』などのシングルカード販売・買取が活発に行われています。ショーケース内のレアカードの回転率は極めて高く、併設されたプレイスペース（デュエルスペース）では公認大会や交流会が頻繁に開催され、プレイヤーたちの情報交換の場として機能しています。
