剪定作業の真価は、病害の予防と樹勢維持において発揮されます。きゅうり栽培で最も警戒すべき「うどんこ病」や「べと病」は、古い葉や土壌に近い多湿環境から感染が拡大するため、適切な下葉取り（下葉剪定）が必須です。
収穫が進んで親づるの下部に実がなくなったら、収穫を終えた節より下にある古い葉や、黄色く退色した葉、地面から約30cm以内の葉をハサミで順次切り落とします。ただし、一度に大量の葉を切ると根への光合成産物供給が途絶えてしまうため、「1回の作業で取り除く葉は1株あたり2〜3枚まで」にとどめるのが鉄則です。これにより株元の風通しが劇的に改善し、薬剤散布の効果も格段に高まります。
また、花の剪定・摘果に関する知識も収量を左右します。日本の主要なきゅうり品種（節成系・飛び節成系）は、受粉しなくても果実が肥大する「単為結果性」を備えています。そのため、花粉を運ぶ虫や人工授粉用の雄花がなくても、雌花さえ咲けば正常な実が育ちます。
花や幼果の管理における現場のポイントは以下の通りです。
- 雄花が密集している場合：雄花は過剰に咲いても養分を消費するため、主枝下段の密集した雄花群は適度に指で摘み落として構いません。
- 1節に複数の雌花がついた場合：1つの節から2〜3個の雌花が同時に咲いた場合は、形の良いものを1つだけ残し、残りの小さな花芽は摘除（摘果）します。養分の競合による奇形果を防ぐためです。
- うどんこ病発病葉の初期対応：白い粉状のカビが確認された葉は、胞子を周囲に撒き散らさないようビニール袋で覆いながら付け根から切除し、直ちに密閉廃棄します。
