林体制の発足後、メディアで最も激しく「辞任・交代」が取り沙汰されたのは、2026年夏に発覚したアメリカンフットボール部員の違法薬物事件への対応でした。この際、記者会見における発言の齟齬や初動対応の遅れが批判の対象となり、一時は「作家理事長の限界」「年内交代か」といった憶測が各種報道を賑わせました。
真相を検証すると、林理事長本人に辞意があったわけではなく、問題の本質は「現場からの情報隠蔽」と「副学長ら実務担当者との深刻な情報断絶」にありました。当時の記者会見や調査委員会の報告書によると、薬物の疑いに関する第一報が林理事長に正確に伝達されるまで大幅なタイムラグが存在し、大学本部の一部幹部が独自判断で事態の収拾を図ろうとしていた事実が判明しています。
公の場で苦渋の表情を浮かべ、「組織のトップとしての責任を痛感している」と語った林理事長は、役員報酬の50%減額（6カ月間）という処分を受け入れつつ、自ら進退伺を出すのではなく「この混乱を収束させ、抜本的な改革をやり遂げることが自身の責任」として続投を選択しました。一部で囁かれた「即時解任」や「自主辞任」の噂は、組織内の権力闘争を煽る一部の憶測に過ぎず、現在も文部科学省との対話を重ねながら改革の陣頭指揮を執り続けています。
