JELLY JELLY CAFEは東京都内だけでも複数店舗を展開しており、立地や客層によって店舗の雰囲気が大きく異なります。訪れる目的に合わせた店舗選びが満足度を大きく左右します。
渋谷店はブランドの発祥の地であり、若年層やグループ利用、外国人観光客が多く集まるフラッグシップ店です。休日の昼過ぎは最も混雑しやすく、当日飛び込みでは満席で入店できないケースが多発します。週末に訪れる際は、公式サイトからの事前Web予約が欠かせません。
新宿店はJR新宿駅各出口からのアクセスに優れ、仕事終わりの会社員や大人のグループ利用が中心です。平日ナイトタイム（18時以降）の稼働率が高く、同僚同士でのレクリエーションや歓送迎会終わりの二次会利用としても定評があります。
池袋店は、アニメ・サブカルチャーファンや女性客の比率が比較的高いエリア特性を持っています。営業時間は13:00から23:00までとなっており、明るく開放的な内装が特徴です。初心者向けのパーティーゲームや協力ゲームが活発に動いています。
秋葉原店は、ディープなボードゲーム愛好家から観光客まで幅広い層が訪れる拠点です。海外の希少なインディーズゲームや「JELLY JELLY GAMES」が手がけるオリジナルタイトルの販売在庫も豊富で、ゲームを購入する目的で立ち寄る利用者も多数見受けられます。
