力関係で言えば、様々なメカを開発し、肉体的にも強いバイキンマンの方が上のはずだ。しかし、バイキン城の主導権は常にドキンちゃんが握っている。彼女が「〇〇が欲しい！」と言えば、バイキンマンはどんな無理難題でも叶えようとする。
この力関係の背景には、バイキンマンの「紳士的な一面」がある。彼は悪役でありながら、女性に対して暴力を振るったり、無理強いをしたりすることは決してない。ドキンちゃんに対する態度は、彼の根底にある優しさと、彼女を失いたくないという強い恐怖心の裏返しでもある。バイキンマンにとって、ドキンちゃんに叱られている時間すらも、孤独を紛らわせる大切な日常なのだ。
