同店をスムーズに攻略するためには、各階の専門性を把握しておくことが欠かせません。綿密に構成されたジュンク堂梅田店のフロアガイドは、地下1階から7階まで明確なテーマ分けがなされています。
- 地下1階（コミック・ライトノベル・アニメ関連）：国内随一のコミック在庫を誇り、新刊から名作、マニアックなインディーズ系まで網羅。
- 1階（雑誌・話題書・新刊・文具・カフェ）：最新トレンドを凝縮したエントランス。梅田 ジュンク堂 文房具として定評のある丸善の上質なステーショナリーコーナーが併設されています。
- 2階（文芸・文庫・新書・実用・趣味）：国内外の小説から文庫、エッセイ、料理や手芸などのライフスタイル書が充実。
- 3階（ビジネス・経済・経営・法律・資格）：ビジネスパーソン御用達のフロア。MBA関連書から税務・法律実務書、資格試験対策テキストまで揃います。
- 4階（人文科学・歴史・思想・哲学・社会）：研究者や思想ファンを唸らせる圧倒的な深度。地方史や専門学会誌のバックナンバーも見当たります。
- 5階（理工学・医学・薬学・看護・自然科学）：建築、ITプログラミング、高度な医学書・薬学書など、プロフェッショナルが頼りにする専門書の牙城。
- 6階（語学・学習参考書・児童書・洋書）：知育玩具や絵本から、大学受験参考書、TOEIC・TOEFL対策、輸入洋書までファミリー・学生向けに構成。
- 7階（イベントスペース・ギャラリー）：著者サイン会や原画展、各種トークイベントが定期開催されるカルチャー拠点。
1階フロアには、丸善が誇る高級万年筆や製図用具、デザイン性の高い輸入文具が並び、ビジネスギフトや自分へのご褒美を探す場としても定評があります。また、買い物合間に立ち寄れるジュンク堂 梅田 カフェ（館内および近接カフェスペース）では、購入したばかりの本のページをめくりながら落ち着いたコーヒータイムを過ごす贅沢な時間が用意されています。
