南姫公民館の大きな魅力は、公営施設ならではのリーズナブルな利用料金にあります。利用時間帯は基本的に「午前（9:00〜12:00）」「午後（13:00〜17:00）」「夜間（18:00〜21:30）」などの時間区分に分かれており、部屋の広さや設備に応じて料金が設定されています。
一般的な会議室や和室であれば1区分あたり数百円程度、大人数を収容できる大集会室でも手頃な価格設定となっています。また、夏季や冬季に冷暖房を使用する場合は、所定の冷暖房費（実費加算）が上乗せされる仕組みです。
営利目的での利用や市外居住者の利用については、料金の割増規定や利用制限が適用されるケースがあります。サークルの月謝徴収を伴う教室や企業研修などで利用を検討している場合は、事前に受付窓口へ利用規約の詳細を確認しておくとトラブルを防げます。
