高校選択の重要な指標となる舟入高校大学進学実績を紐解くと、地元最難関の総合大学である広島大学合格実績推移において、毎年30名〜40名前後の合格者を安定して輩出していることが確認できます。医学部医学科や旧帝国大学（京都大学、大阪大学、九州大学など）への進学者も二桁台を維持しており、学年上位層の学力水準は極めて高いレベルにあります。
さらに見逃せないのが私立大学への進路実績です。関関同立（同志社大学・立命館大学・関西学院大学・関西大学）には毎年延べ200名以上の合格実績を叩き出しており、早慶上理やMARCHへの進学熱も盛んです。特に国際コミュニケーションコースの卒業生は、国際教養大学（AIU）や上智大学、ICUといった語学・リベラルアーツ系学部に強みを発揮しています。
校内選抜の競争率が高い舟入高校指定校推薦大学一覧には、早稲田大学、慶應義塾大学、東京理科大学、明治大学、立教大学、同志社大学、関西学院大学など、首都圏・関西圏の有力私立大学の推薦枠がずらりと並びます。評定平均4.3〜4.5以上を維持した生徒がこれらの指定校推薦を獲得するケースが多く、一般入試を見据えながらも校内定期テストで堅実に結果を残し続けた生徒に大きなアドバンテージが用意されています。
