鳴門大橋は高規格幹線道路である「神戸淡路鳴門自動車道」の一部を構成しています。本州側（神戸・明石方面）から淡路島を経由して徳島県へアクセスする場合、ETCを利用することで大幅な通行料金の割引が適用されます。
例えば、本州側の起点となる垂水IC・舞子トンネル周辺から鳴門ICまでの区間を普通車で走行する場合、ETC休日割引や平日朝夕割引の適用条件を満たすことで移動コストを賢く抑えることが可能です。淡路島の南端である淡路島南ICから鳴門北ICまでの大鳴門橋単体区間も、ETC利用によりスムーズかつ割安に通過できます。
週末や大型連休（ゴールデンウィーク、お盆、阿波おどり期間）には、明石海峡大橋周辺や淡路サービスエリア（SA）付近を先頭にした渋滞が発生しやすくなります。日本道路交通情報センター（JARTIC）やJB本四高速の道路交通情報サイトを活用し、リアルタイムの渋滞状況や所要時間の推移をチェックしながら出発時間を調整するのが得策です。
