東京湾アクアラインは首都圏と房総半島を直結する大動脈であるため、休日の特定時間帯に激しい渋滞が発生します。現在導入されているETC時間帯別ロードプライシングでは、土日祝日の上り線（木更津→川崎方面）において、13時から20時までの時間帯が値上げ設定（普通車1,200円など）、前後の深夜・早朝・夜間が割引設定（400円〜600円）となる変動料金制が運用されています。
この料金施策の影響により、海ほたるPAの混雑状況にも明確な波が現れています。SNSや現場利用者の生の声を集約すると、混雑のピークは主に2回訪れます。
- 第1ピーク（11:00〜14:00）：下り線（木更津方面）を利用する観光客の昼食・休憩利用が集中し、4階・5階の飲食店に行列が発生。
- 第2ピーク（16:00〜19:30）：房総半島からの帰り便となる上り線利用者がアクアブリッジの渋滞を前に海ほたるへ避難。駐車場入場待ちの車列が本線まで伸びるケースも散見。
混雑を回避して快適に過ごすための裏ワザは、「あえて早朝（8時前）のモーニング利用」または「20時以降の夜景ディナー利用」にシフトすることです。早朝は空気が澄んで東京湾越しの富士山がくっきりと現れやすく、20時以降はピーク料金を避けた車が徐々に流れ始めるため、駐車場やレストランの混雑が大幅に緩和されます。出発前にはNEXCO東日本の道路交通情報サイト「ドラとら」や公式混雑予測カレンダーを確認しておくのが鉄則です。
