屋内施設を訪れる際、保護者や来場者がもっとも懸念するのがいきもの探検隊の臭い・衛生面への配慮です。過去の密閉型ペットショップなどのイメージから「独特の獣臭がこもっているのではないか」と不安視する声もあります。
現地調査および利用者のフィードバックによると、最新の店舗では大型換気空調設備や次亜塩素酸除菌システムが常時稼働しており、入館直後に強烈な悪臭を感じるケースは稀です。ただし、ヒヨココーナーや小型哺乳類の飼育エリア周辺では、生物本来の自然な匂いや敷材の香りが多少漂います。館内各所にアルコール消毒液や専用手洗い場が整備されており、動物に触れた直後に手洗いを徹底できる環境が整えられています。
続いていきもの探検隊の混雑状況と所要時間について検証します。土日祝日の13時〜15時はベビーカー連れのファミリーで通路が混雑しやすく、人気動物のふれあいコーナーで数分程度の順番待ちが発生することがあります。平均的な滞在時間は45分から90分程度となっており、ショッピングモール内を散策する前後のアクティビティとして無理のない時間配分が可能です。