神村学園高等部の受験を検討する際、最初に把握しておくべきなのが学科・コースごとの学力レベルの明確な違いです。ひと口に「神村学園」といっても、国公立・難関私大進学を目指す特別進学コースから、専門職直結の医療系・技術系、アスリート特化コースまで多岐にわたるため、偏差値だけで一括りに評価することはできません。
大手模試データおよび鹿児島県内入試動向によると、学園トップの学力を誇る文理科（特別進学コース等）の偏差値は50〜53で推移しています。九州エリアの私立中堅進学校と同水準であり、手厚い少人数指導により国公立大学や有名私立大学への合格実績を堅調に伸ばしています。
一方、高い人気を誇る看護学科の偏差値は48前後です。5年一貫教育で最短20歳での正看護師資格取得を狙える実利性の高さから、鹿児島県外からも倍率が集まりやすい傾向にあります。また、全国大会常連の部活動生が多数在籍する普通科（特別能力コース・キャリアデザインコースなど）や調理科、保育科は偏差値40〜44前後となっており、学力試験そのものの難易度よりも、面接や実技、明確な目的意識や部活動実績が合否を大きく左右します。
