近年の寺社巡りブームに伴い、「雲巌寺で御朱印をいただきたい」と御朱印帳を持参する参拝者が後を絶ちません。しかし、ここで絶対に知っておくべき決定的な事実があります。
雲巌寺では、原則として参拝者向けの御朱印の授与・記帳を行っていません。
この対応の背景には、同寺が現在も厳しい戒律と日課に従って修行に励む「専門道場（僧堂）」であるという事情があります。観光寺院のように社務所や納経窓口が常時開設されているわけではなく、雲水たちは坐禅や作務（掃除・薪割りなどの労働）に専念しています。そのため、寺務所の呼び鈴を鳴らして無理に御朱印を求めたり、修行僧の業務を妨げる行為は厳に慎まなければなりません。
また、拝観ルールについても一般の観光地とは異なる明確な境界線が敷かれています。
- 堂内・修行エリアへの立ち入り禁止：参拝が許されているのは屋外の境内参道のみであり、本堂や庫裏などの建物内部への立ち入りは固く禁じられています。
- 写真撮影のマナー：境内や建造物の外観撮影は可能ですが、修行中の僧侶に向けた無断撮影や、ドローンを用いた空撮などは全面禁止されています。
- 静寂の維持：大声での会話や飲食、ペットを連れての無秩序な立ち入りは避け、静かに歩みを進めるのが最低限の礼儀です。
