長崎大学の学びの舞台は、地理的に分散した複数の拠点から成り立っている。教養教育や文系・理系の主要学部がひしめく文教キャンパス、医学・歯学・薬学といった医療系教育の核心を担う坂本キャンパス、そして伝統ある経済学部が拠点を置く片淵キャンパス。それぞれの地区で独自の時間割構成や実験・実習スケジュールが走る。
全学共通科目や他学部振替科目を履修する場合、キャンパス間の移動時間を考慮した履修を組まなければならない。市内電車やバスの運行ダイヤ、朝夕の交通渋滞を見越したスケジューリングが、日々の講義への遅刻や欠席を回避するカギとなる。