物語の根幹を支えてきた4大主人公は、現在それぞれ全く異なる環境に身を置いています。キメラ＝アント編での壮絶な戦いを経て、彼らの能力と立場には劇的な変化が生じました。
ゴン＝フリークスは、ネフェルピトー戦で自らに課した過酷な制約と誓約（いわゆる「ゴンさん」化）の代償により瀕死となりましたが、キルアとナニカの力によって一命を取り留めました。しかし、覚醒時にオーラを使い果たした影響で、現在は「オーラが出ない（視えない）一般人」の状態に戻っています。故郷であるくじら島へ帰還し、ミトさんと共に学生としての勉学に励みながら、「自分は何をしたいのか」という根本的な問いに向き合っています。
キルア＝ゾルディックは、ゾルディック家の呪縛（イルミの針）を完全に打ち破り、妹であるアルカ（ナニカ）を守りながら世界を旅しています。念能力は変化系を極めた「神速（カンムル）」を完成させており、肉体の限界を超えた超高速戦闘が可能です。精神的な自立を果たしたキルアは、現在ゴンとは別行動を取り、家族としての平穏な時間を過ごしています。
クラピカは、現在進行中の暗黒大陸航路（ブラックホエール1号）における実質的な主人公として最前線に立っています。十二支んの「子」の席を引き継ぎ、カキン帝国第14王子・ワブルとその母オイトの護衛を担当。具現化系能力である5本の鎖に加え、緋の眼発動時に全系統の潜在能力を100%引き出す「絶対時間（エンペラータイム）」、さらに他者の念能力を一時的に奪って具現化イルカに解析・委託発動させる「奪う人差し指の鎖（ステルスドルフィン）」を駆使し、船内の情報戦を支配しています。
レオリオ＝パラディナイトは、念願だった医師免許取得を目指す医学生でありながら、会長選挙編での圧倒的人気を経て十二支んの「亥」に就任しました。チードル率いる医療班の一員としてブラックホエール1号に乗船しています。放出系能力として放つ「遠隔打撃（触診やメス代わりのオーラ放出）」は、ジン＝フリークスからもその有用性を高く評価されており、未開の地での医療支援において極めて重要な鍵を握っています。
