庄内FCは2015年に地元出身のサッカーファンによって設立されました。最初の活動は地元の公園で練習を開始しました。当初は10人程度のメンバーでしたが、徐々に参加者が増えていきました。
2016年には地域の子供向け大会で初優勝を果たしました。これをきっかけに、クラブの知名度が上がりました。2018年には成人チームを立ち上げ、県リーグに参戦開始しました。
設立から現在まで、庄内FCは地域のサッカーを盛り上げる存在となっています。設立者の想いが込められたクラブです。
設立当初は資金面や選手不足に苦しみましたが、地元住民の協力で乗り越えました。毎年、練習を重ねてレベルアップを図っています。2019年にはジュニアユースを新設し、育成体制を強化しました。
2020年は新型コロナウイルスの影響で活動が中断されましたが、2021年に再開して順調に復活。2022年には準優勝を達成し、注目を集めました。2023年は10試合中6勝3敗1分で上位争いに入り、クラブの基盤が確立されました。
