Suicaを連携させたスマートEXでは、指定席だけでなく自由席の購入も可能です。予約画面で自由席を選択して決済を完了させれば、指定席と同様にSuica1枚で自由席車両へ乗り込めます。
さらに、スマートEXを利用することで通常のエドモンソン式紙切符よりも割安に乗車できる特典があります。
代表的な割引プランが「EX早特」シリーズです。乗車日の21日前や7日前、3日前までに予約することで、東京〜名古屋・新大阪間などの区間が大幅に値引きされます。ゴールデンウィークやお盆、年末年始などの繁忙期に設定される全席指定席期間でも、ネット上で空席を見ながら素早く座席確保が可能です。
頻繁に出張や旅行で新幹線を利用するビジネスパーソンの場合は、年会費1,100円（税込）が発生するものの年間を通じて割引率がさらに高い「エクスプレス予約（EX予約）」を選択するのも有効な選択肢です。エクスプレス予約でもSuicaへの番号紐付け手順はスマートEXと共通仕様となっています。
