しかし、技術の進化は常に法制度との摩擦を生む。同人誌の多くは、既存のアニメやゲームの二次創作、いわゆる「グレーゾーン」の文化に支えられている。デジタル流通がスマート化し、グローバル規模で瞬時に拡散するようになると、版元（公式権利者）も無視できなくなる。
2026年現在、一部の先進的なゲームメーカーは、デジタル同人誌の売上から一定割合をロイヤリティとして自動回収するシステムを試験的に導入し始めている。これにより、ファンは公式公認の形で堂々と二次創作を販売できるようになり、グレーゾーンから「クリーンな共生関係」への移行が模索されている。
