事件の発生に伴い、東日本旅客鉄道（JR東日本）は長野駅構内および善光寺口周辺の出入口を一時的に一部制限。駅構内アナウンスで利用客への注意喚起と安全確保を呼びかけた。北陸新幹線や在来線の運行ダイヤに大規模な運休は生じなかったものの、改札口周辺には物々しい警戒態勢が敷かれ、利用客には緊張感が広がった。
JR東日本側は駅構内の巡回警備を急遽強化。鉄道警察隊や民間警備員を要所に配置し、不審物の確認や利用客の誘導に全力を挙げた。観光拠点としても機能する大型ステーションの足元で起きた事件だけに、ソフト・ハード両面におけるターミナルの安全管理が改めて問われる形となった。
