D-nahaビルの大部分を占めるジュンク堂書店那覇店のフロア構成は、目的の本を素早く探せるだけでなく、偶然の知の出会いを創出する導線設計が施されています。
フロアマップの概略は以下の通りです。
- 1階（エントランス・話題書・新刊・文具）：雑誌、新刊単行本、話題の文芸書、ビジネス書、文房具・雑貨コーナーが広がります。通勤・通学途中のクイックな立ち寄りに最適なレイアウトです。
- 2階（実用書・児童書・コミック・文庫）：旅行ガイド、料理・趣味の実用書、学習参考書、絵本・児童書、膨大なコミックおよび文庫・新書が配置されています。ファミリー層や中高生の滞在時間が最も長いフロアです。
- 3階（専門書・学術書・沖縄郷土書・イベントスペース）：理工書、医学書、法律・経済、人文科学、語学、芸術書が整然と並びます。特筆すべきは国内最高峰の規模を誇る沖縄郷土資料コーナーであり、県内出版社から個人出版の私家版まで網羅されています。フロア内には著者サイン会や出版記念トークショーが開催されるイベントスペースも設置されています。
- 地下1階（カフェ併設ゾーン・リラクゼーションスペース）：静かな環境で読書を楽しめるカフェが併設されており、購入した本をコーヒーとともにじっくり味わうサードプレイスとして親しまれています。
