過去に世間を大きく揺るがしたJCの不祥事ニュースの中でも、特に広く知られているのが2018年に起きた公式キャラクター「宇予くん」を巡る大炎上です。
日本青年会議所（日本JC）の国家意識醸成を担当する委員会が主導し、Twitter（現X）上でキャラクターアカウントを運用していましたが、特定のアジア諸国や政治家、メディアに対して度重なる中傷・差別的発言を行っていたことが発覚しました。ネット上の猛反発を受けて日本JCはアカウントを削除し、「不適切な発言で多くの方々に不快な思いをさせた」として公式に謝罪文を公表、担当役員の解任などの処分を行いました。
この事件は、公益性を持つはずの全国組織が匿名アカウントを使ってネット工作を行っていた点や、組織的なチェック機能がまったく働いていなかった点で、極めて厳しい批判にさらされました。
また、政治的中立性を保つべき公開討論会の場において、特定政党や候補者への偏った誘導が疑われて紛糾した事例など、政治と組織の距離感を巡るトラブルも散発しています。
