鮮やかな縦3色の配色にも、深い歴史的意義が込められています。もともと緑は独立への「希望」、白は宗教的「純潔」、赤は統一に向けた「情熱」を表していました。独立戦争の過酷な道のりを経て、現代では緑が「希望」、白は「統一」、赤は国の礎となった「英雄たちの血」を意味すると再解釈されています。
1810年にスペインからの解放を求めて立ち上がった「独立の父」ミゲル・イダルゴ神父の呼びかけから始まった壮絶な闘争は、メキシコのアイデンティティを確立する大きな契機となりました。現在ではメキシコ合衆国政府の厳格な法律によって、色合いの比率や中央の紋章の位置が微細に至るまで規定されています。