南風原高校の卒業後の進路は、学科の特性を色濃く反映したバランスの取れた実績となっています。
就職希望者に対しては、介護福祉科を中心とした医療・福祉施設への就職内定率が極めて高く、県内有名企業や公務員（自衛官・警察官・消防等）への合格実績もあります。手厚い面接指導や履歴書添削が行われるため、就職決定率は毎年高水準を維持しています。
進学分野においては、看護・リハビリ・保育・調理・IT系などの専門学校への進学がボリュームゾーンを占めます。四年制大学・短期大学への進学では、指定校推薦や総合型選抜（旧AO入試）を活用して、県内私立大学（沖縄国際大学、沖縄大学など）や県立看護大学、さらには琉球大学などの国公立大学へ進学する生徒も毎年生み出しています。
