乙宮神社の名を神秘的なものにしている最大の要因が、境内外に遺された「不思議な伝説」の数々です。古くから地元古老の間では、「社殿の奥にある岩穴や古井戸は海底の竜宮城へと通じている」「夜更けに海鳴りが響くと境内上空を青白い光が走る」といった怪異譚が語り継がれてきました。
民俗学的な調査によれば、これらの伝説の真相は古代海洋民族の航海技術と信仰の痕跡に深く関係しています。沿岸部や河川流域に築かれた乙宮神社は、かつて船乗りたちが潮の流れや天候を予測するための重要な指標でもありました。海神の使いとされるウミヘビやサメ（和邇）への畏怖が、時を経て神聖な龍神信仰へと昇華し、現代に残る幻想的な民話の原型となったのです。
