多くの患者や家族が抱く最大の疑問が、「医療がここまで進歩したのに、なぜB型肝炎は完治しないのか」という謎です。その秘密は、両ウイルスの根本的な増殖メカニズムの違いに隠されています。
C型肝炎ウイルス（HCV）は「RNAウイルス」です。肝細胞の中に侵入したHCVは、細胞の「細胞質」と呼ばれる核の外側で増殖を繰り返します。人間の生命の設計図が保管されている「細胞核」の内部には決して入り込みません。そのため、ウイルスのタンパク質合成酵素をピンポイントで阻害するDAA製剤（直接作用型抗ウイルス薬）を8〜12週間ほど飲み続ければ、細胞質内のウイルス複製を完全に封じ込め、自浄作用によって体内から跡形もなく一掃することが可能です。これがC型肝炎で95%から99%を超える圧倒的な完治率を叩き出せる論理的根拠です。
これに対し、B型肝炎ウイルス（HBV）は極めて悪質な構造を持つ「DNAウイルス」です。細胞内に侵入したHBVは、人間の細胞核の深奥部に潜り込み、「cccDNA（共有結合閉環状DNA）」という強固な構造物を形成して居座り続けます。さらに、人間の染色体DNAそのものにウイルスの遺伝子配列を組み込んでしまう「インテグレーション」という現象を引き起こします。
現在広く用いられている「核酸アナログ製剤」（エンテカビルやテノホビルなど）は、血液中のウイルス増殖を劇的に抑え、肝機能数値を正常化させる極めて優れた薬です。しかし、核内に深く根を張ったcccDNAを直接破壊することは現代の技術でもできません。薬の服用を自己判断で中断すれば、休眠していたcccDNAから再びウイルスが爆発的に複製され、急速な肝炎の再燃を招きます。肝炎最新治療の研究現場では、siRNA製剤や侵入阻害薬を組み合わせた「機能的治癒（Functional Cure）」を目指す治験が精力的に続けられているものの、体内からウイルスを根絶やしにするハードルは依然として高いままです。
