彼の食生活を語るうえで欠かせないのが、日常的に愛食されている「納豆」のアレンジ術です。木村流の納豆レシピはメディアでも度々紹介され、多くのファンが実践しています。
定番として知られるのが、「納豆＋ハチミツ」や「納豆＋オリーブオイル＋オリゴ糖」といった意外性のある組み合わせ。腸内環境を整える善玉菌のエサとなる成分を効率よく摂取するため、調味料のチョイスにも科学的かつ実用的な配慮がなされています。また、家族の食卓には季節の無農薬野菜や海藻類、良質なタンパク質である魚介類が並び、白砂糖や化学調味料を極力避けた手作りの発酵調味料（塩麹や自家製味噌など）が多用されている点も特徴です。
