同校のアイデンティティを語る上で避けて通れないのが、全国にその名を轟かせるサッカー部の存在です。全国高等学校サッカー選手権大会や全国高校総体（インターハイ）において幾多の栄冠を勝ち取ってきた歴史を持ち、近年でも高円宮杯 JFA U-18 サッカープリンスリーグ東海での激戦を繰り広げています。
「藤枝東高校 サッカー部 メンバー」の構成を見ると、県内外の有力クラブチームや中学校から高い志を持った有望株が集結しています。人工芝グラウンドをはじめとする充実したトレーニング環境に加え、藤枝東サッカー部OB会・後援会による物心両面での手厚い支援体制は、全国の公立高校の中でも突出しています。
しかし、特筆すべきはサッカー部だけではありません。静岡県教育委員会の公表資料によると、近年では登山部が全国高校総体で輝かしい実績を残し、弓道部なども東海総体の上位に進出するなど、多様な部活動で全国クラスの活躍が続いています。生徒たちは「東高生である以上、部活動も行事も勉強も一切妥協しない」という強い誇りを共有しています。
校風はまさに「文武両道」の具現化です。登校時から生徒たちの表情は引き締まり、朝の読書や小テスト、密度の濃い授業を終えると、すぐさまグラウンドや体育館、各部活動の練習拠点へと駆け出します。部活動終了後には校内の自習スペースや近隣の塾で再びペンを握る生活が日常化しており、生半可な気持ちではついていけないタフな現場環境が形成されています。
