ペットボトル風車が回らない最大の要因は、「回転軸にかかる摩擦力」と「風を受ける羽の角度設計の狂い」の2点に集約されます。市販の風力発電機と同様に、風車は空気抵抗（抗力）と風が羽の傾斜を滑り落ちる力（揚力）のバランスによって回転モーメントを生み出します。
なかでも構造上、極めて重要な役割を担っているのが「ビーズ」の存在です。ペットボトルのキャップ部分や底部と支持針金が直接接触すると、素材同士の摩擦係数が高くなり、微風程度のエネルギーでは回転が止まってしまいます。ここに小さな丸型プラスチックビーズを1〜2粒挟み込むだけで、接触面積が点接触となり、ベアリング（軸受）と同様の摩擦軽減効果を発揮します。
また、使用する容器の選択も回転効率を大きく左右します。工作初心者には加工が容易な500mlの炭酸飲料ボトル（断面が真円で表面に凹凸が少ないもの）が適していますが、畑などで強いトルク（回転力）と大きな振動を生み出したい場合は、ペットボトル風車2リットル角型・丸型の大型ボトルが威力を発揮します。容器のサイズと用途に応じた空気力学的なアプローチが、軽快な回転を実現する出発点です。
