感染後すぐの体調不良に襲われた際、最も厄介なのが「病勢のぶり返し」と「新たな再感染」の見分けである。感染症の第一線で発信を続ける忽那賢志医師ら専門家は、症状の質的な変化と発症のタイムラインを慎重に観察する必要性を説く。新型コロナウイルス感染症診療の手引き作成委員会プロジェクトがまとめる臨床指針でも、鑑別の難しさが指摘されている。
抗ウイルス薬の服用終了後に起きるウイルスリバウンドであれば、初回と同種の症状（軽度の咳や倦怠感）が数日再燃したのちに速やかに軽快することが多い。一方、新たな変異株による再感染の場合、劇症的な喉の激痛、突然の38度以上の再発熱、あるいは初回にはなかった強い消化器症状（下痢や嘔気）など、独立した「新たな急性期症状」として現れる傾向がある。治りかけの微熱と軽視して市販薬でやり過ごすと、気付かぬうちに周囲へ強い感染力を撒き散らすリスクがある。
