島旅を計画する上で最も注意したいのが、往路の始発と復路の直島行き最終便の時間です。特に夜間帯は便数が激減し、乗り遅れると島外へ戻れなくなるリスクがあるため、主要な時間帯を頭に入れておく必要があります。
宇野港発の始発フェリーは午前6時台から動き出し、朝8時台・9時台の便は美術館の開館時間に合わせて多くの乗客で賑わいます。直島（宮浦港）から宇野港へ戻る最終便はフェリーが20時30分発、その後23時台まで深夜小型船が運航されています。ただし、JR宇野線の接続終電や岡山方面への最終電車を考慮すると、20時前後の便には乗船しておくのが現実的な選択肢です。
対して高松港ルートは、高松発の始発が8時台、直島（宮浦港）から高松港へ戻る最終フェリーは17時00分発と早い時間帯に設定されています。これ以降は高速船（19時45分発など）を利用することになりますが、定員に達すると乗船できないケースもあるため、高松宿泊の方は夕方の便の確保を最優先に行動してください。
