ネット上の掲示板や動画サイトで流布した情報の中には、技術的な勘違いによる誤情報が多数含まれています。
典型的な誤解の一つが「なぞのばしょ」です。「なぞのばしょに行けば幻のポケモンが手に入る」という言説がファイアレッドの裏技として紹介されるケースが見られますが、これは『ダイヤモンド・パール』に存在するマップ読み込み不具合を利用したバグ技であり、GBA世代のファイアレッドでは構造上発生しません。
また、本作特有のシステムとして注意すべきが「徘徊型伝説ポケモン(ライコウ・エンテイ・スイクン)」にまつわる仕様です。初期出荷版のカートリッジにおいて、徘徊中のポケモンがバトル中に「ほえる」を使用して逃走した場合、データフラグの処理不具合により二度とマップ上に出現しなくなる致命的なバグが存在します。遭遇時は「くろいまなざし」などで逃走を封じるか、即座にマスターボールを投げる対策が必須です。