茨城県内の高校受験において、水城高校が強固な存在感を示し続ける最大の原動力が、極めて手厚い特待生制度（奨学生制度）です。学業成績優秀者に対して学費負担を大幅に軽減するシステムが確立されており、経済的な理由から私立を敬遠しがちな家庭にとっても有力な選択肢となっています。
特待生制度には複数のランクが設定されています。最上位の「Z特待（またはSZ特待）」では、入学金・授業料・施設設備費が全額免除となり、実質的に公立高校以下の学費負担で充実した私立教育を受けられる仕組みです。次いで「A特待（授業料全額免除）」「B特待（授業料半額免除）」「C特待（入学金免除等）」と段階的に設定されています。
水戸一高などの難関公立高校に万が一不合格となった場合でも、「水城のZ特待やSUコースなら、公立トップ校に引けを取らない進学指導が受けられる」という安心感を受験生・保護者に与えており、県立受験のセーフティネットとして機能しています。ただし、特待生資格は入学後も定期的な学業成績や生活態度によって継続審査が行われるため、高校進学後も継続した学習習慣が求められます。
