私立進学校を選択する際、保護者にとって重要な判断材料となるのが学費と諸費用です。滝中学校・滝高等学校の学費は、授業料、施設設備費、PTA会費などを合わせて年間約80万〜90万円程度となっています。初年度は入学金（約20万円）や制服代・教材費などが加わりますが、首都圏の私立中高一貫校と比較しても標準的であり、手厚い教育内容や設備を考慮すれば極めてコストパフォーマンスが高いと言えます。
また、滝高等学校の指定校推薦枠については、早稲田大学、慶應義塾大学、上智大学、東京理科大学、MARCH、関関同立など、全国の主要私立大学から豊富な枠が用意されています。しかし、生徒の大半が国公立大学や医学部への一般受験を目指すため、難関私大の推薦枠が活用されずに余るケースも珍しくありません。一般入試で堂々と勝負する学力を全員に身につけさせるという学校の指導方針が窺えます。
