京都府警察は事件発覚直後から大規模な捜査本部を設置し、延べ数千名におよぶ捜査員を投入してきた。刑事部を中心に、現場周辺のしらみつぶしの聞き込みと、大規模な行方不明者捜索が展開されている。
単なる失踪にとどまらず、第三者が関与した刑事事件の可能性を強く視野に入れ、あらゆる角度からの捜査が継続中だ。河川敷や山林、空き家などの徹底的な捜索と並行し、過去の類似事例との関連性についても広域的なデータベース照合が行われている。一刻も早い発見と真相解明に向け、現場の捜査員たちは昼夜を問わず執念の追跡を重ねている。