元木氏のプライベートを語る上で欠かせないのが、2000年に結婚した元日本テレビアナウンサーの妻・大神いずみさんの存在です。現役引退後のタレント転身期からコーチ時代の激務まで、元木氏の健康管理とメンタル面を献身的に支え続けてきました。近年ではテレビ番組で夫婦揃って出演する機会も多く、包み隠さない掛け合いが共感を呼んでいます。
夫婦の間には2人の息子が誕生しており、共に野球の道へと進んでいます。長男の元木翔大（しょうた）さんは、名門・履正社高校などで白球を追い、甲子園出場を目指して奮闘した経歴を持ちます。次男の元木瑛介（えいすけ）さんも中学・高校世代の硬式野球チームで主力として活躍し、父親譲りの高い野球センスで注目を集めてきました。プロ入りや大学野球へのステップアップなど、今後の進路選択においても元木家の教育方針である「自ら考え、悔いなくやり切る姿勢」が一貫して反映されています。
