スーパーはくとの普通車（指定席・自由席）とグリーン車の間には、長距離移動の疲労度を大きく左右する明確な差が設けられています。快適性を追求したグリーン車の車内構造とアメニティ環境の詳細は以下の通りです。
座席配置は、普通車の横4列（2+2列）に対して、グリーン車は横3列（2+1列）の贅沢なレイアウトを採用しています。シート幅が大幅に拡張されているだけでなく、前後間隔（シートピッチ）も普通車の970mmから1,160mmへと約19cm拡大されており、大柄な大人でも足を思い切り伸ばして寛ぐことができます。
リニューアル工事が完了した客室内は、鳥取の伝統工芸や落ち着いたトーンの内装材が奢られ、静粛性も普通車より一段高く設計されています。気になる電源環境については、グリーン車の各座席（肘掛け下または側壁）にモバイル充電用コンセントが設置されており、車内フリーWi-Fiサービスとともにビジネスや観光リサーチをストレスなくサポートします。
