「カプセルモンスター」という単語を検索する際、多くのユーザーが遭遇するのが高橋和希氏原作の『遊☆戯☆王』に登場する作中ゲーム『カプセルモンスターズ(CAPSULE MONSTERS / カプモン)』との混同です。
『遊☆戯☆王』の初期エピソードに登場するカプセル・モンスター・チェス(CAPMON)や、後に海外を中心にスピンオフ展開されたアニメ『Yu-Gi-Oh! Capsule Monsters』は、カプセルからモンスターを召喚してボードゲーム上で戦わせるルール。発想の根底には同じくカプセルトイ文化やチェス要素が存在しますが、ポケモンの原案企画とは全く別の独立した作品です。
1990年代は「カプセルから何かが出現する」というギミックが玩具・ホビー界で非常に強力な魅力を持っていた時代であり、双方の作品がそれぞれ異なるアプローチで独自のエンターテインメントへと発展させました。