渋谷駅で最も混乱を招きやすいのが、「南改札」と「新南改札」の混同です。名称こそ似ていますが、改札の所在フロアと直結する商業施設・エリアが全く異なります。
1階にある「南改札」は、長年親しまれてきた旧来の南口にあたるエリアです。改札を出て右手が「西口（モヤイ像・バスターミナル方面）」、左手が「東口（渋谷ストリーム・明治通り方面）」となっており、地上レベルで東西を行き来する幹線ハブとして機能しています。
一方、3階に位置する「JR渋谷駅新南改札」は、再開発に伴い旧恵比寿寄りの僻地から駅直上へ移転新設された改札口です。大規模複合施設「渋谷サクラステージ」と「渋谷ストリーム」を結ぶ国道246号横断デッキに直結しており、桜丘町や並木橋方面へ段差なしでアクセスできる新たな玄関口となっています。
